南京双一流大学排名**的是南京大学，排名第二的是东南大学，排名第三的是南京理工大学，以下是具体排名情况，供大家参考。
1、南京大学
南京大学(Nanjing University)，简称“南大”，是中华人民共和国教育部直属、中央直管副部级建制的综合性全国重点大学，是历史悠久、声誉卓著的百年名校。位列首批国家“双一流“**一流大学A类建设高校、”211工程“、”985工程”，入选“珠峰计划”、“111计划”、“2011计划”、“卓越工程师教育培养计划”、“卓越医生教育培养计划”、“卓越法律人才教育培养计划”，是九校联盟、中国大学校长联谊会、环太平洋大学联盟、21世纪学术联盟和东亚研究型大学协会成员。
南京大学其学脉可追溯自孙吴永安元年(258年)的南京太学，近代校史肇始于1902年创建的三江师范学堂，此后历经两江师范学堂、南京高等师范学校、国立东南大学等历史时期，1949年由民国时期中国*高学府“国立中央大学”易名“国立南京大学”，1950年径称“南京大学”并沿用至今。1920年在中国国立高等学府中首开“女禁”，引领男女同校之风。*早在中国开展现代学术研究，建立中国*早的现代科学研究实验室，成为中国**所以大学自治、学术自由、文理为基本兼有农工商等专门应用科、集教学和研究于一体的现代大学，被国际上誉为“东方教育的中心”。
2、东南大学
东南大学(Southeast University)，简称“东大”，位于江苏省会南京，是中华人民共和国教育部直属、中央直管副部级建制的全国重点大学，建筑老八校及原四大工学院之一，国家首批双一流(A类)、211工程、985工程重点建设高校，入选2011计划、111计划、卓越工程师教育培养计划、卓越医生教育培养计划、***大学生创新创业训练计划、国家大学生创新性实验计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、全国深化创新创业教育改革示范高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校、教育部来华留学示范基地，卓越大学联盟、中俄工科大学联盟、中欧工程教育平台”、长三角高校合作联盟主要成员，国家国防科技工业局与教育部共建。
东南大学前身是创建于1902年的三江师范学堂。以南京高等师范学校为基础建立国立东南大学，下设工科，其后工科又经历国立第四中山大学工学院、国立中央大学工学院、国立南京大学工学院等历史时期;1952年全国院系调整，以原南京大学工学院为主体，并入复旦大学、交通大学、浙江大学、金陵大学等学校的有关系科，在中央大学本部原址建立了南京工学院;1988年5月，学校复更名为东南大学;2000年4月，原东南大学、南京铁道医学院、南京交通高等专科学校合并，南京地质学校并入，组建新的东南大学。
3、南京理工大学
南京理工大学(Nanjing University of Science and Technology)，简称“南理工”，位于古都南京市，北依紫金山，西临明城墙，是一所隶属于中华人民共和国工业和信息化部的全国重点大学，素有“兵器技术人才摇篮”的美誉。
学校创建于1953年，前身是中国人民解放军军事工程学院(“哈军工”)炮兵工程系，经历炮兵工程学院、华东工程学院、华东工学院等发展阶段，1993年，更名为南京理工大学。2017年9月，入围一流学科建设高校名单。
4、南京航空航天大学
南京航空航天大学(Nanjing University of Aeronautics and Astronautics)简称南航，是中华人民共和国工业和信息化部直属的一所具有航空航天民航特色、以理工类为主的综合性全国重点大学，是国家211工程、985工程优势学科创新平台重点建设高校，是国家**一流学科建设高校，入选卓越工程师教育培养计划、111计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、新工科研究与实践项目、中国政府奖学金来华留学生接收院校、全国深化创新创业教育改革示范高校、国家大学生文化素质教育基地，为中俄交通大学联盟成员。
学校前身是1952年10月以511厂为基础创建的南京航空工业专科学校，是中华人民共和国创办的**批航空高等院校之一;1978年，被国务院确定为全国重点大学;1981年，经国务院批准成为全国首批具有博士学位授予权的高校;2012年12月，工业和信息化部、中国民用航空局签署协议共建南京航空航天大学。2018年12月，工业和信息化部、教育部、江苏省共建南京航空航天大学。
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